Prirodno-matematički fakultet  je  osnovan 1960. godine, odlukom nadležnog organa Narodne Republike Bosne i Hercegovine (Službeni list, broj 50/60) o  izdvajanju Prirodno-matematičkog odsjeka  iz Filozofskog fakulteta, čime postaje  samostalna naučno-nastavna ustanova, koja objedinjava prirodne i matematičke nauke.

Danas je Prirodno-matematički fakultet organizaciona jedinica Univerziteta u Sarajevu koja daje ogroman doprinos u naučnoj prepoznatljivosti i vidljivosti Univerziteta u Sarajevu, ne samo u regionalnim nego i u globalnim svjetskim okvirima, o čemu svjedoče naučni uspjesi naših bivših studenata koji su sadašnji  zaposlenici Prirodno-matematičkog fakulteta ili su zaposlenici renomiranih univerziteta i insititucija diljem svijeta.